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苹果手机短信自动删除可能有以下几个原因。
1、短信自动删除可能是因为在存储管理功能中设置了“自动删除短信”，如果开启了这一功能，当手机存储空间不足时，系统会自动删除一些较早的短信来释放空间，可以在设置中查看短信存储设置，确认是否开启了该功能。
2、也有可能是手机中存在定时清理短信的第三方软件，这些软件的设置可能会导致短信自动删除，可以在软件设置中查看是否有这样的功能并关闭。
3、苹果手机的iOS系统自身也可能出现自动删除短信的情况，当设备处于低电量模式时，系统会自动关闭一些后台应用和功能以节省电量，其中就包括短信功能，如果手机曾经连接过iTunes或其他iCloud设备备份并选择了覆盖当前数据，也可能导致短信自动消失。
针对以上原因，可以尝试相应的解决方法，例如关闭自动删除短信的设置、关闭第三方软件的自动清理功能、保持手机电量充足或检查并调整备份设置等，如果这些方法无效，建议联系苹果官方客服寻求进一步的帮助，重要短信建议备份以防丢失。